DERS TANITIM BİLGİLERİ


Dersin Adı
Hücre Ölüm Mekanizmaları
Kodu
Yarıyıl
Teori
(saat/hafta)
Uygulama/Lab
(saat/hafta)
Yerel Kredi
AKTS
GBE 340
Güz/Bahar
3
0
3
5
Ön-Koşul(lar)
Yok
Dersin Dili
İngilizce
Dersin Türü
Seçmeli
Dersin Düzeyi
Lisans
Dersin Veriliş Şekli -
Dersin Öğretim Yöntem ve Teknikleri
Dersin Koordinatörü
Öğretim Eleman(lar)ı
Yardımcı(ları) -
Dersin Amacı Bu dersin amacı, öğrencilere hücre ölüm mekanizmalarının temel prensiplerini anlatmak ve bu mekanizmaların gelişim, fizyoloji ve patolojideki rollerini tanıtmaktır. Dersin içeriği, hücre ölüm mekanizmaları alanında apoptoz, otofaji, nekroz, nekroptoz, lizozom-aracılı hücre ölümü, entoz, anoikis, ferroptoz, piroptoz, anastaz, mitotik ölüm ve immunojenik hücre ölümü gibi çok çeşitli konuları kapsamaktadır.
Öğrenme Çıktıları Bu dersi başarıyla tamamlayabilen öğrenciler;
  • Hücre ölüm mekanizmalarının temel prensiplerini açıklayabilecek
  • Bu prensipleri alandaki güncel sorunları çözmede uygulayabilecek
  • Hücre ölüm mekanizmalarını analiz etmede kullanılan yöntemleri tartışabilecek
  • Bu alandaki bilimsel çalışmaları tasarım, hipotez ve değer yönünden değerlendirebilecek
  • Farklı hücre ölüm mekanizmaları arasındaki karşılıklı etkileşimleri açıklayabilecek
  • Hücre ölüm mekanizmalarının embriyonik gelişim sürecindeki rollerini tanımlayabilecek
  • Hücre ölüm mekanizmalarındaki düzensizliklerin kanser ve nörodejeneratif hastalıklar gibi patolojik durumların oluşumuna nasıl yol açabileceğini tanımlayabilecektir
Ders Tanımı Hücre ölümünün moleküler mekanizmaları, apoptoz, otofaji, nekroz, nekroptoz, lizozom-aracılı hücre ölümü, entoz, anoikis, ferroptoz, piroptoz, anastaz, mitotik ölüm ve immunojenik hücre ölümü
Dersin İlişkili Olduğu Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

 



Dersin Kategorisi

Temel Ders
Uzmanlık/Alan Dersleri
Destek Dersleri
İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri
Aktarılabilir Beceri Dersleri

 

HAFTALIK KONULAR VE İLGİLİ ÖN HAZIRLIK ÇALIŞMALARI

Hafta Konular Ön Hazırlık
1 Hücre ölüm mekanizmalarına giriş Alberts et.al. 6th Edition. Chapter 18.
2 Apo(p)Toz mu a-POP-toz mu? Giriş Alberts et.al. 6th Edition. Chapter 18.
3 İç apoptotik yolak Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
4 Dış apoptotik yolak Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
5 Apoptoz çalışma yöntemleri Hugh J. M. Brady. Apoptosis Methods and Protocols. Humana Press 2004. https://doi.org/10.1385/1592598129
6 Nekroz ve nekroptoz Galluzzi, L et al. “Molecular definitions of cell death subroutines: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2012” Cell death and differentiation vol. 19,1 (2011): 107-20.
7 Anoikis, ferroptoz ve piroptoz Kroemer, G et al. “Classification of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2009” Cell death and differentiation vol. 16,1 (2008): 3-11.
8 Otofaji-aracılı hücre ölümü Kroemer, G et al. “Classification of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2009” Cell death and differentiation vol. 16,1 (2008): 3-11.
9 Lizozom-aracılı hücre ölümü Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
10 Mitotik ölüm Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
11 Hücre-içinde-hücre ölümü (entoz, kanibalizm ve emperitoz) Douglas R Green. Means to an End: Apoptosis and Other Cell Death Mechanisms. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2017. Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
12 Prokaryotlarda programlanmış hücre ölümü Hochman A. Programmed cell death in prokaryotes. Crit Rev Microbiol. 1997;23(3):207-14.
13 Immunojenik hücre ölümü Galluzzi L, Buqué A, Kepp O, Zitvogel L, Kroemer G. Immunogenic cell death in cancer and infectious disease. Nat Rev Immunol. 2017 Feb;17(2):97-111. doi: 10.1038/nri.2016.107. Epub 2016 Oct 17.
14 Anastaz, mitotik yıkım ve hücresel yaşlanma gibi ölümcül olmayan süreçler Sun G and Montell DJ. Q&A: Cellular near death experiences-what is anastasis? BMC Biol. 2017 Oct 24;15(1):92. doi: 10.1186/s12915-017-0441-z. Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
15 Dönem tekrarı
16 Final sınavı
Ders Kitabı

Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, David Morgan, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Molecular Biology of the Cell. Sixth Edition. Chapter 18 – Cell Death. Garland Science, 2014: New York and Abingdon, UK.

Douglas R Green. Means to an End: Apoptosis and Other Cell Death Mechanisms. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2017.

Önerilen Okumalar/Materyaller

Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.

Galluzzi, L et al. “Molecular definitions of cell death subroutines: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2012” Cell death and differentiation vol. 19,1 (2011): 107-20.

Kroemer, G et al. “Classification of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2009” Cell death and differentiation vol. 16,1 (2008): 3-11.

Sun G and Montell DJ. Q&A: Cellular near death experiences-what is anastasis? BMC Biol. 2017 Oct 24;15(1):92. doi: 10.1186/s12915-017-0441-z.

 

DEĞERLENDİRME ÖLÇÜTLERİ

Yarıyıl Aktiviteleri Sayı Katkı Payı %
Katılım
Laboratuvar / Uygulama
Arazi Çalışması
Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği
Portfolyo
Ödev
1
25
Sunum / Jüri Önünde Sunum
1
25
Proje
Seminer/Çalıştay
Sözlü Sınav
Ara Sınav
1
20
Final Sınavı
1
30
Toplam

Yarıyıl İçi Aktivitelerin Başarı Notuna Katkısı
3
70
Yarıyıl Sonu Aktivitelerin Başarı Notuna Katkısı
1
30
Toplam

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU

Yarıyıl Aktiviteleri Sayı Süre (Saat) İş Yükü
Teorik Ders Saati
(Sınav haftası dahildir: 16 x teorik ders saati)
16
3
48
Laboratuvar / Uygulama Ders Saati
(Sınav haftası dahildir. 16 x uygulama/lab ders saati)
16
Sınıf Dışı Ders Çalışması
16
2
32
Arazi Çalışması
Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği
Portfolyo
Ödev
1
10
Sunum / Jüri Önünde Sunum
1
20
Proje
Seminer/Çalıştay
Sözlü Sınav
Ara Sınavlar
1
20
Final Sınavı
1
20
    Toplam
150

 

DERSİN ÖĞRENME ÇIKTILARININ PROGRAM YETERLİLİKLERİ İLE İLİŞKİSİ

#
Program Yeterlilikleri / Çıktıları
* Katkı Düzeyi
1
2
3
4
5
1

Matematik, Fen Bilimleri ve Biyomedikal Mühendisliği konularında yeterli bilgi sahibidir; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanır.

2

Karmaşık Biyomedikal Mühendisliği problemlerini saptar, tanımlar, formüle eder ve çözer; bu amaca uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçer ve uygular.

3

Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlar; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygular.

4

Biyomedikal Mühendisliği uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirir, seçer ve kullanır.

5

Karmaşık Biyomedikal Mühendisliği problemlerinin veya araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz eder ve yorumlar.

6

Biyomedikal Mühendisliği disiplini içinde ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışır; bireysel çalışma sergiler.

7

Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurar; etkin rapor yazar ve yazılı raporları anlar, tasarım ve üretim raporları hazırlar, etkin sunum yapar, açık ve anlaşılır talimat verir ve alır.

8

Biyomedikal Mühendisliği uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın mühendislik alanına yansıyan sorunları hakkında bilgi sahibidir; mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçlarının farkındadır.

9

Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilincine sahiptir; mühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi sahibidir.

10

Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi sahibidir; girişimcilik, yenilikçilik hakkında bilinçlidir; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi sahibidir.

11

Bir yabancı dili kullanarak Biyomedikal Mühendisliği ile ilişkili konularda, bilgi toplar ve meslektaşları ile iletişim kurar.

12

İkinci yabancı dili orta düzeyde kullanır.

13

Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilincindedir; bilgiye erişir, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izler ve kendini sürekli yeniler; insanlık tarihi boyunca oluşan bilgi birikimini Biyomedikal Mühendisliği alanıyla ilişkilendirir.

*1 Lowest, 2 Low, 3 Average, 4 High, 5 Highest